Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ska3Q8C263 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ska3Q8C263 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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