Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Nek11Q8C0Q4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek11Q8C0Q4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms