Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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FarsaQ8C0C7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FarsaQ8C0C7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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