Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm33263-201ENSMUST00000220371 459 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm8024-201ENSMUST00000167099 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trim35Q8C006 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trim35Q8C006 Cst10-203ENSMUST00000109939 606 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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