Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube3dQ8BX13 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube3dQ8BX13 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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