Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp40Q8BWR4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp40Q8BWR4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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