Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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