Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc30Q8BVF4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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