Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc2Q8BKV1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms