Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Atg4dQ8BGV9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms