Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms