Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Jmjd4Q8BFT6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms