Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
ChfrQ810L3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms