Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Lrfn4Q80XU8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Lrfn4Q80XU8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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