Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg2bQ80XK6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atg2bQ80XK6 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atg2bQ80XK6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg2bQ80XK6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms