Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pcsk9Q80W65 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pcsk9Q80W65 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms