Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms