Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Dsg1cQ7TSF0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1cQ7TSF0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms