Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Actn1Q7TPR4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Actn1Q7TPR4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms