Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tmed3Q78IS1 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms