Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih3Q6ZWS4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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