Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vstm2lQ6PDS0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms