Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CltbQ6IRU5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms