Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nop58Q6DFW4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nop58Q6DFW4 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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