Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ctnna3Q65CL1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ctnna3Q65CL1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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