Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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PtprdQ64487 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprdQ64487 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprdQ64487 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms