Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Trim24Q64127 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trim24Q64127 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms