Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Ccdc18Q640L5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc18Q640L5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc18Q640L5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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