Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PcolceQ61398 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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PcolceQ61398 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PcolceQ61398 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PcolceQ61398 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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