Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BcanQ61361 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms