Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hcfc1Q61191 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hcfc1Q61191 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hcfc1Q61191 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hcfc1Q61191 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Hcfc1Q61191 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hcfc1Q61191 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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