Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cln3Q61124 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cln3Q61124 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cln3Q61124 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms