Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms