Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tbc1d1Q60949 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms