Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Traf3Q60803 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Traf3Q60803 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Traf3Q60803 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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