Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Foxd4Q60688 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Foxd4Q60688 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Foxd4Q60688 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Foxd4Q60688 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Foxd4Q60688 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Foxd4Q60688 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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