Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tsr1Q5SWD9 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tsr1Q5SWD9 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tsr1Q5SWD9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tsr1Q5SWD9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tsr1Q5SWD9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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