Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ssh2Q5SW75 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms