Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim58Q5NCC9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim58Q5NCC9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim58Q5NCC9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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