Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ecm2Q5FW85 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms