Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf608Q56A10 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf608Q56A10 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms