Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Syne3Q4FZC9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Syne3Q4FZC9 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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