Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Fam220aQ3ZN08 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Fam220aQ3ZN08 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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