Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc185Q3V118 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms