Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm21943-201ENSMUST00000178181 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pantr1-211ENSMUST00000186656 647 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lrrc43Q3V0L5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc43Q3V0L5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms