Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
E130208F15RikQ3UPV3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms