Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc33Q3ULW6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc33Q3ULW6 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms