Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx27Q3UHD6 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx27Q3UHD6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms