Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Puf60Q3UEB3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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