Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtpbp6Q3U6U5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms